Melanjutkan kisah sebelumnya, musim kedua dari Ao no Hako ini membawa penonton kembali mengikuti kelanjutan perjalanan cerita yang berfokus pada dinamika hubungan serta aktivitas klub olahraga para karakternya.
Berbagai tantangan baru dan perkembangan emosional mulai terungkap seiring keseimbangan antara kehidupan sekolah, ambisi pribadi, dan kedekatan antar-karakter yang semakin diuji dalam keseharian mereka.